灼舌症是個難以解釋卻存在的疾病，目前朝著小神經病變的方向來理解，是一種神經痛 (neuropathic pain)。因為病例少，治療的經驗多是來自病例報告。最近有兩篇論文，皆提到肉毒桿菌的治療。
其中一篇是直接打在舌頭上及牙齦上，做皮下注射，如圖，一個點打4u/0.1ml，共打4個位置，達到很好的療效。原因不在於麻痺肌肉，而是利用肉毒桿菌治療神經病變疼痛的原理。
另一篇則是提出口腔、舌頭的疼痛和咀嚼肌群、上頸部肌群、顳顎關節有關。灼舌症的患者很多也有咬合問題及顳顎關節疾病。治療顳顎關節時需要治療這些肌肉群; 同樣地處理這些肌肉，也可能改善灼舌症。論文有三例只用了物理治療來放鬆，其中一例因為合併磨牙的問題所以也用上了肉毒桿菌來治療，都有不錯的療效。
可能的原因包括
- 過度反應的咀嚼肌，造成舌肌的微創傷，引起小神經的病變。
- 咀嚼肌 (ex. 內翼肌、二腹肌)，上頸椎肌肉的激痛點 (ex. 上斜方肌、胸鎖乳突肌)，造成舌頭、口腔的感傳疼痛 (referred pain)。
- 舌下神經受到緊繃的肌肉 (特別是外翼肌) 夾擠，造成神經病變而產生症狀。
當我們用藥物、神經的方向來治療灼舌症卻無法獲得很好的療效時，也可以嚐試從肌肉不平衡的角度來治療，或是直接用上肉毒桿菌注射。
